Informationen zum Seminar Stochastische Modelle in der Biologie (SS 2016)
Dozent:
Prof. Dr. P. Pfaffelhuber
Assistenten/Betreuer:
Peter Czuppon, E-Mail: czuppon@stochastik.uni-freiburg.de, Sprechzeiten: Di 9-11, Mi 10-12 und n.V., Raum: 231a
Felix Hermann, E-Mail: felix.hermann@stochastik.uni-freiburg.de, Sprechzeiten: n.V., Raum: 231
Termin: Mo 14-16 Uhr (ct)
Ort: Seminarraum 232, Eckerstraße 1
Neuigkeiten
- Die Liste der vorläufigen Termine wurde überarbeitet. (30.05.2016)
Literatur
1) Ullah, M. und Wolkenhauer, O. - Stochastic Approaches for Systems Biology:
Dieses Buch können Sie aus dem Netzwerk der Universität unter diesem Link als PDF herunterladen.
2) Erdi, P. und Lente, G. - Stochastic Chemical Kinetics:
Ein Exemplar dieser Quelle finden Sie als Präsenzbestand im Semesterapparat des Stochastik-Teils der Bibliothek des mathematischen Instituts.
Vorträge
Ziel der Vorträge ist es den Teilnehmenden des Seminars eine Einführung in das jeweilige Thema zu geben. Dabei sollten die zentralen Stellen der jeweiligen Thematik ausführlich dargestellt werden. Des Weiteren ist ein Handout mit den wichtigsten Definitionen und Aussagen des Vortrags zu erstellen.
Der Vortrag sollte in etwa 90 Minuten lang sein, wobei er sich ggf. auch über mehrere Sitzungen verteilen kann, d.h. alle angegebenen Termine sind vorläufig.
Es wird erwartet, dass Sie bis auf begründete Ausnahmefälle regelmäßig am Seminar teilnehmen.
Bitte vereinbaren Sie spätestens zwei Wochen vor Ihrem Vortrag einen Termin mit dem Assistenten, um Fragen und Struktur des Vortrags zu besprechen.
Vorläufige Termine
Datum | Thema | Betreuer |
18.4.2016 | Stochastic Formulation | P. Czuppon |
25.4.2016 | Propensity as a Transition Rate | F. Hermann |
02.5.2016 | Discrete Stochastic Simulation | P. Czuppon |
30.5.2016 * | Chemical Masters Equation | F. Hermann |
30.5.2016 * | The 2MA-Approach | F. Hermann |
06.6.2016 ** | Outline of the 2MA-Approach | F. Hermann |
06.6.2016 ** | Fluctuations Near Instabilities | P. Czuppon |
13.6.2016 | Gene Expression | P. Czuppon |
20.6.2016 | Compartmental Systems | F. Hermann |
27.6.2016 | Autocatalysis | P. Czuppon |
04.7.2016 | Enzyme Kinetics | P. Czuppon |
* Am 30.5.2016 findet ein Doppeltermin statt, beginnend wie üblich um 14:00 ct.
** Am 06.6.2016 findet erneut ein Doppeltermin statt, beginnend um 14:00 ct.